Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx1P70314 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx1P70314 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx1P70314 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx1P70314 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx1P70314 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx1P70314 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx1P70314 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx1P70314 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms