Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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