Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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