Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gp1bbP56400 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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