Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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