Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SqleP52019 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SqleP52019 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms