Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms