Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ercc3P49135 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc3P49135 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms