Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms