Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Epb41P48193 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms