Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx1-2P42580 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms