Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf9P41274 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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