Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa5P28312 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Defa5P28312 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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