Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fcer1aP20489 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms