Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SagP20443 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SagP20443 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SagP20443 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms