Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TP20293 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TP20293 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TP20293 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TP20293 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TP20293 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TP20293 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TP20293 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TP20293 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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TP20293 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TP20293 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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