Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NefhP19246 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NefhP19246 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms