Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms