Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms