Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ly6c1P0CW02 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms