Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf1P09925 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms