Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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