Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01655 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01655 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01655 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01655 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01655 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01655 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01655 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01655 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01655 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01655 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01655 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01655 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms