Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01647 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01647 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01647 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01647 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms