Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlkO54988 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlkO54988 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlkO54988 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms