Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb3O54890 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms