Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChkaO54804 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChkaO54804 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChkaO54804 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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