Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Abcc1O35379 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Abcc1O35379 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Abcc1O35379 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Abcc1O35379 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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