Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms