Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms