Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vmn1r58G3X9U3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms