Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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