Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms