Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp54bE9PXC0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms