Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms