Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms