Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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