Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms