Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf3B2RQG2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms