Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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