Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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