Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frmpd4A2AFR3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms