Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
A0A0U1RNP2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RNP2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms