Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms