Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cib1Q9Z0F4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cib1Q9Z0F4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms