Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms