Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms