Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Six6Q9QZ28 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Six6Q9QZ28 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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