Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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