Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms